近日，北京林业大学草业与草原学院与山东大学、北京动物园合作研究的一项成果以“Convergent gut microbial functional strategies drive energy metabolism adaptation across Ursidae species and challenge the uniqueness of giant panda”为题在线发表在微生物生态学国际顶尖期刊The ISME journal（IF=11）上。该研究通过分析大熊猫、亚洲黑熊、棕熊和北极熊等4种熊科动物的肠道微生物季节动态，并结合粪便微生物移植实验，揭示了熊科动物肠道微生物在能量代谢调节中的关键作用，挑战了传统认为大熊猫肠道微生物功能具有独特性的观点。

北京林业大学薄亭贝副教授、海南大学徐小明（原动物所博士后）、北京动物园刘赫研究员为论文共同第一作者，北京林业大学薄亭贝和山东大学王德华教授为该论文共同通讯作者。北京动物园和中国科学院动物研究所相关人员参与该工作。

本研究得到国家自然科学基金（32200381，32470487）项目的支持。

图1 四种熊的肠道菌群组成比较与肠道菌群季节性变化

7月，薄亭贝副教授联合中科院动物所雷富民研究员团队和山东大学王德华教授团队在美国微生物学会(ASM)旗下mSystems杂志在线发表题为“Mechanism of gut microbiota promoting adaptation of tree sparrows to high-altitude environments”的论文，揭示树麻雀高原适应的机制。该研究首次在野生高原鸟类中利用菌群移植技术，将树麻雀肠道微生物移植给斑胸草雀（图2），结合微生物组与转录组学，共同表明了一种适应性策略，即树麻雀利用其肠道微生物群来调节能量代谢，最终在资源有限的高海拔环境中节约能量。

北京林业大学薄亭贝副教授、中科院动物所宋刚副研究员、张梦茹、海南大学徐小明博士后为论文共同第一作者，动物所雷富民研究员和山东大学王德华教授为该论文共同通讯作者。

该研究受到国家自然科学基金（32200381，32470487）和国家重点研发计划（2022YFC2601601）项目的支持。

图2 树麻雀菌群移植

6月，北京林业大学薄亭贝副教授联合中国科学院动物研究所、中国疾病控制中心传染病预防控制所在环境毒理学一区期刊Ecotoxicology and Environmental Safety杂志发表题为“Small mammal activities structure fine-scale soil microbial communities and coordinate rodenticide effects in the typical steppes of China”的研究论文。该项研究以布氏田鼠（Lasiopodomys brandtii）为对象，首次探讨了中国内蒙古草原啮齿动物活动和杀鼠剂使用对土壤的相互作用效应。

图3 田鼠活动和杀鼠剂的使用对土壤抗生素抗性基因和土壤元素循环有显著影响

该研究论文中科院动物所刘伟副研究员和北京林业大学薄亭贝副教授为共同第一作者。薄亭贝和中科院动物所肖治术研究员为本文通讯作者。

本研究得到国家自然科学基金重大项目（32090024）和中国科学院动物研究所自主创新科研计划（2024IOZ0105）以及国家自然科学基金（32200381, 32470487）和科技基础资源调查计划（2023FY100305）的支持。

论文链接：

Bo TB, Xu XM, Liu H, Tang LQ, Xu HL, Zhao SQ, Lv JZ and DH Wang 2025 Convergent gut microbial functional strategies drive energy metabolism adaptation across Ursidae species and challenge the uniqueness of giant panda. The ISME Journal (https://doi.org/10.1093/ismejo/wraf201).

Tingbei Bo, Gang Song, Mengru Zhang, Xiaoming Xu, Jundong Duan, Huishang She, Yun Fang, Wenting Li, Jing Wen, Jingsong Liu, Dehua Wang, Fumin Lei, Gut microbiota contribute to high-altitude adaptation in tree sparrows, mSystems, Volume 10, Issue 8,https://doi.org/10.1128/msystems.00630-25.

Liu W, Bo T, Zhao N, Hu B, Li G, Xiao Z. Small mammal activities structure fine-scale soil microbial communities and coordinate rodenticide effects in the typical steppes of China. Ecotoxicol Environ Saf. 2025 Sep 1;302:118560. https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2025.118560