近日，生态与自然保护学院携手中国科学院动物研究所、贵州师范大学、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、英国伦敦动物学会动物研究所等国内外多家科研机构，在国际顶级综合学术期刊《Science Advances》（近五年IF = 14.1，中科院一区Top）在线发表题为“Genetic legacy and recent cross of two ancient lineages underlie the rebound of the world’s rarest primate”（doi: 10.1126/sciadv.adw3298）的研究论文（Feature article）。该研究基于一套可靠的粪便基因组数据获取流程，系统揭示了海南长臂猿种群恢复的遗传基础。

海南长臂猿（Nomascus hainanus）是全球最濒危的灵长类动物之一。20世纪50年代以来种群锐减，2003年野外仅存约13只；经过持续保护，截至2024年恢复至约42只。然而，其种群回升背后的遗传机制仍不清晰。由于个体隐蔽分散，获取高质量DNA样本困难，粪便样本虽为非损伤性取样方式，但宿主DNA含量低、易降解，长期制约基因组研究。

图1 海南长臂猿粪便基因组数据获取及质量控制技术流程图

为突破技术瓶颈，研究团队自2017年起开展系统采样，建立了覆盖样本采集、DNA富集与数据质量控制的标准化流程（图1），并验证粪便基因组数据具有较低误差率，可支撑种群遗传学分析。基于18只个体（约占现存种群40%）的基因组数据，研究发现海南长臂猿的恢复既源于保护措施，也得益于其长期演化形成的“遗传遗产”。过去一千年的种群扩张缓冲了末次盛冰期（LGM）遗传瓶颈影响，高重组区域有助于降低遗传负荷。现存种群包含两个古老谱系并已发生自然杂交；模型显示，持续杂交将提升种群增长潜力并降低灭绝风险。该研究强调，整合种群历史与基因组结构信息，是理解濒危物种恢复机制的关键；所建立的低误差粪便基因组流程，为非损伤性遗传研究提供了技术范式。

本研究由我校生态与自然保护学院2018级博士研究生侯羡（已毕业）、潘胜凯教授、徐基良教授为共同第一作者，中国科学院动物研究所詹祥江研究员、贵州师范大学周江教授为共同通讯作者。