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计算生物学中心统计遗传学研究获进展

发表时间:(2018-12-13)

  近日,国际重要植物期刊《The Plant Journal》(近五年影响因子6.11,植物科学一区)发表我校计算生物学中完成的心数量性状基因定位方法论文。

 

      论文题为“Adissectionmodelformappingcomplextraits”,破解了复杂性状QTL定位的一项关键技术。计算生物学中心研究人员,把复杂性状根据其生理、解剖、形态特征,分解为若干相互作用的亚性状,利用数学模型勾画出各个亚性状生长发育的动态轨迹,将之嵌入GWAS分析的统计框架之中,以此对各个亚性状的遗传构建进行动态定位,全方位地勾画出复杂性状基因型—表型关系图谱。

 

  这一研究思路被证明是有效的。从两套杨树QTL定位数据中均获得具有生物学意义的QTL。研究发现,对欧美杨(P. euramerica)树干材积组成性状—高度、胸径与干形指数的联合定位,比对材积本身的直接定位更能有效地发现木材形成的QTL。研究还发现,对胡杨(P.euphratica)总侧根长度的遗传定位可通过对其组成性状—单个侧根长度与侧根数量的联合定位来提高QTL定位功效。

 

  计算生物学中心的这项研究工作,从理论上解决了复杂性状基因解析难题。作为“Technical Advances”发表在这一植物顶端期刊,显示了该工作的理论创新与应用潜力。

 

  论文第一作者是计算生物学中心的博士生桑蒙蒙,硕士生石贺欣、韦昆,青年教师叶梅霞、姜立波、孙丽丹参与部分工作。邬荣领为责任作者。论文受到高精尖项目等资助。(aler)

 

  论文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.14185

 

来源:计算生物学中心          作者:梁丹          浏览次数: